全长16 s测序服务
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解决满16 s rRNA基因PacBio HiFi测序和生物信息学分析。
公正的样品制备
标准化和严格的质量控制程序与微生物标准提供准确和可靠的数据。
快速的周转时间
收到完整的16 s测序结果在3周
一个更好的方法来解决物种密切相关
全面的生物信息学分析
内部分析专家Bioinformaticians的支持我们的团队
全长16 s rRNA测序服务报告提供成分栏情节,成分的热图,alpha-diversity和β多样性阴谋,并与LEfSe统计组比较。我们的专家团队bioinformaticians在这里帮助您充分利用您的数据。
查看样例报告准确的微生物分析
ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准(D6305)被用作基准控制。Zymo研究全长16 s测序提供了相同的细菌分析微生物群落DNA标准中的定义。
给你访问的技术专家团队
微生物基因组测序解决方案使用最新的技术
Zymo研究的经验丰富的科学家小组在这里回答你的问题和使用您创建的“端到端微生物基因组测序与分析”你的目标。获得今天为您的项目咨询最新的生物技术。
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全长16 s扩增子测序技术规格
| 测序平台 | PacBio续集Ile |
|---|---|
| 测序工具 | SMRT细胞8米 |
| 目标扩增子 | 全长16 s rRNA基因放大了27个r f (AGRGTTYGATYMTGGCTCAG)和1492 (RGYTACCTTGTTACGACTT) |
| 接受样品类型 | 提取基因组DNA,或者原始样本 |
| DNA提取 | 96年ZymoBIOMICS Magbead DNA (D4308) ZymoBIOMICS DNA Miniprep (D4300) |
| 图书馆准备 | 我们遵循PacBio推荐协议(https://www.pacb.com/wp-content/uploads/Procedure-checklist-Amplification-of-bacterial-full-length-16S-rRNA-gene-with-barcoded-primers.pdf) |
| 质量控制 | 积极控制DNA提取(ZymoBIOMICS微生物群落标准,D6300)和积极的控制库的准备(ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准,D6305)都包含在每个项目的质量控制。结果报道在最后的项目报告。-提取控制和- qPCR控制也监控和实时PCR可以分析要求。 |
| 测序分析 | 扩增子序列变异(ASV)基础分析DADA2用于提供更高的精度和更好的分辨率的数据。 |
| 参考数据库 | 公开的数据库(例如绿色煤电、团结)含有大量的错误,不一致的注释,序列质量差,我们利用内部策划参考数据库。 |
| 数据可视化 | 绝对丰度箱线图、类群丰富barplot类群丰富的热图,ASV丰富的热图,α多样性箱线图和稀疏曲线,β多样性3 d皇帝的阴谋,Taxa2ASV分解器 |
| 统计分析 | LEfSe分析揭示了这些类群/特征分布在不同定义样本组。 |
全长16 s测序的优势进行微生物分析
针对16 s rRNA基因测序放大某些变量地区已经成为一种流行的微生物组成和常规技术分析。传统上,研究者依赖短内容测序平台(例如Illumina公司MiSeq)对于这个应用程序。然而,短内容排序read-length限制这个应用程序到一个或几个变量的区域16 s rRNA基因,例如V4, V3-V4, V1-V3, v2 v1和V4-V5。结果,分类决议是有限的。
通过引入读测序平台(e。g PacBio续集二世和牛津纳米孔测序),研究人员现在可以利用完整的分类解析完整的16 s rRNA基因的力量。全长16 s测序读技术是最新的。
Zymo研究微生物分析的前沿,是为数不多的全长16 s测序服务提供者。根据我们的口号“让科学简单”,我们十分乐意在全长16 s测序客户产品的前沿。Zymo研究很高兴结合PacBio HiFi测序和纠错生物信息学分析(例如Dada2),这样我们就可以恢复错误全长16 s序列从混杂的微生物群落(e。g土壤或粪便)。我们提供这个强大的全长16 s微生物研究者和行业合作伙伴的测序服务。作为认证PacBio提供者你放心吧,你的样品将会很好的照顾,因为他们接受全长16 s测序。
