Zymo研究发布开源生物信息学在污水管道SARS-CoV-2变异检测
提前释放的VirSieve™生物信息学管道将促进环境SARS-CoV-2研究合作
Zymo研究释放VirSieve™开源环境微生物生物信息学管道源代码社区促进全球合作和支持SARS-CoV-2变异的检测废水。
欧文加州(5月11日,2021)——Zymo研究发布VirSieve™生物信息学管道源代码,环境微生物学社会促进全球合作和支持SARS-CoV-2变异的检测废水。VirSieve™是一个自动化计算管道的分析顺序读取SARS-CoV-2病毒污水样品中更好地理解病毒变异出现在监控社区。评级观察病毒突变的置信区间,该软件有可能大大提高分析的准确性在病毒遗传物质的任何更改。
根据疾病控制和预防中心,尽管疫苗的部署有一个巨大的积极影响抑制SARS-CoV-2大流行在美国,新的病毒株仍出现。这些菌株,如B.1.1.7,被列为“关注”的变体由于增加了传播的证据,致病性或疫苗逃税。废水下一代测序正成为最可行的解决方案接近实时的社区监测。
病毒测序从废水很难由于碎片和病毒RNA的降解,常常导致测序错误,最终表现为虚假的突变。VirSieve™可以识别这些虚假的变异和马克是低或没有信心,让研究人员筛选突变有更高程度的支持。Zymo研究还提供了DNA / RNA盾™试剂,保障病毒RNA从进一步退化的任何病毒失活后安全、环境温度收集和运输废水样品。
“Zymo研究之前开发的公共软件工具像Zymo研究传输项目,开源客户端提交COVID-19测试结果通过CalREDIE公共卫生报告系统,”迈克尔·温斯坦博士说,实验室信息系统主任和项目领导VirSieve™Zymo管道项目的研究。“VirSieve™是Zymo研究正在进行的努力提供最大限度的支持,全球流感大流行的应对工作。我们觉得VirSieve™有潜力不仅用于跟踪SARS-CoV-2病毒的变异菌株废水,但其他病毒,为未来公共卫生的努力。”
“从临床样本获得准确的变异或污水是适当的关键位置的病毒毒株上下文中的所有其他病毒变异和通知病原体跟踪工作,”克里斯托弗·梅森博士说,他是一个付费的议长Zymo研究的主任WorldQuant研究所定量预测和威尔康奈尔医学生理学和生物物理学教授。
更多信息关于VirSieve™管道访问Zymo研究的网站或通过电子邮件联系他们tech@zymoresearch.com。
关于Zymo研究集团。
Zymo研究是一个私营公司,一直服务于科学和诊断社区自1994年以来与最先进的分子生物学工具。“科学之美是让事情变得简单”是他们的座右铭,这反映在他们所有的产品,从表观遗传学DNA / RNA净化技术。历史上公认的领袖在表观遗传学,Zymo研究打破界限的新解决方案样本收集,microbiomic测量,诊断设备,和门店技术高质量和易于使用。必威体育电脑版遵循Zymo研究脸谱网,LinkedIn,推特,Instagram。
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