是的。这种一体化的设备,您可以生成rrb图书馆与你兴趣的基因组DNA。然而,试剂库量化和粒度分布特征不提供,需要提供的客户和/或他们的测序服务供应商,以确保最佳实践测序。

原则上,Zymo-Seq rrb图书馆装备可以应用于任何物种的基因组DNA,只要一个参考基因组存在后续的生物信息学分析和基因组DNA 10至500 ng高质量(一个好的经验法则“高质量”的DNA是小退化和大部分内容是高于10 kb)。

可以生成库不到10 ng基因组DNA;然而,这些库的质量是没有保证的。

可以从FFPE生成库提取的DNA样本。然而,由于这种DNA的降解,图书馆的质量将受到影响。增加输入金额可能会有所帮助,但库的质量是没有保证的。

我们使用Nanodrop量化输入DNA或量子位,但任何方法应该做的。输入应该RNA-free基因组DNA。

我们提供12预混独特的双指数(UDI)引物组包,因此可以多路12库。如果你想多路更多,请下令Zymo-Seq UDI底漆板(指标1 - 96,猫。不。D3096分别)。

每图书馆收益率取决于输入基因组DNA的质量和其他因素。一般来说,每个库的产量大约是300 ng或更多(如果量化Nanodrop)后说明书推荐的PCR循环。

最佳的阅读序列长度和深度取决于项目的目标和随后的生物信息学分析。一般来说,在处理哺乳动物样本,50个基点单头或paired-end测序应该rrb库通常有比较短的插入。长读长也是可能的如果一个人想要覆盖尽可能多的CpG网站。此外,渲染意味着覆盖每CpG网站推荐。