如何选择一个DNA和RNA净化设备吗

保证高质量的DNA和RNA寻找任何下游应用程序包括PCR和下一代测序吗?随着新的净化技术的出现,这个过程从来都不是一件容易的事。现在,先进的净化技术适用于即使很小的输入大量的核酸和洗脱量低,从凝胶净化DNA和RNA,酶促反应和不洁净或稀释样品。然而,随着大量的可用选项,它可以很难导航装备将是最适合的。探索每个工具的功能和区分他们从下面类似的选项。

选择正确的净化设备

关键原则:

核酸类型
片段大小
污染物

这三个原则规定工具包是合适的。蛋白质和盐污染可以普遍在任何样品。净化设备是最好的,如果想删除任何多余的盐,蛋白质,非公司染料/荧光和核苷酸和苯酚。

或者,OneStep PCR抑制剂删除工具消除抑制下游应用程序的环境样品中常见的污染物。类别为核酸纯化及其最优应用双链和单链DNA和RNA是列在表1和表2所示。

基于核酸类型的净化设备

DNA纯化试剂盒:

	DNA清洁&集中器(DCC)	基因组DNA清洁&集中器(gDCC)	益生元清洁&集中器(OCC)	OneStep PCR抑制剂删除工具	Zymoclean DNA凝胶回收试剂盒	Zymoclean大片段DNA恢复工具包	Select-a-size DNA清洁&集中器套件
核酸	dsDNA	dsDNA	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸	dsDNA	dsDNA	dsDNA
片段大小	50个基点——10 kb	10 kb - 200 kb	16 - 200元	只有结合抑制剂	50个基点——10 kb	10 kb - 200 kb	≥50个基点
格式	列 96年好磁珠	列 96年好	列 96年好	列 96年好	列 96年好	列	列磁珠
常见的应用程序	聚合酶链反应清理	提取gDNA清理	小低聚糖清理	除环境抑制剂	DNA的大小选择从琼脂糖凝胶	从琼脂糖凝胶gDNA大小选择	DNA和门店库大小的选择
删除	盐、蛋白质、非公司染料/荧光和核苷酸和苯酚	胡敏酸、单宁、多酚黑色素	盐、蛋白质和基于大小的碎片

DNA清洁&集中器(DCC)包和基因组DNA清洁&集中器(gDCC)包优化dsDNA但能够绑定单链核酸类型。然而,益生元清洁&集中器套件(OCC)利用化学绑定更多有利于小双链或者是单链碎片。

Zymo研究凝胶的复苏和Select-a-Size DNA清洁&集中器套件删除多余的盐,蛋白质,和碎片以及执行大小选择。的Zymoclean恢复工具从琼脂糖凝胶提供精确提取核酸,而Select-a-Size DCC包净化所需的,可调范围的DNA片段大小。

RNA净化用品:

	RNA清洁&集中器(RCC)	益生元清洁&集中器(OCC)	OneStep PCR抑制剂删除工具	Zymoclean凝胶RNA恢复工具包	ZR小rna页面恢复工具包
核酸	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸	dsDNA 极 ssRNA 互补脱氧核糖核酸
片段大小	≥17元	16 - 200元	只有结合抑制剂	≥500元	≥17元
格式	列 96年好磁珠	列 96年好	列 96年好	列	列
常见的应用程序	提取或转录RNA清理	小低聚糖清理	除环境抑制剂	从琼脂糖凝胶RNA大小选择	小RNA的大小选择页面凝胶
删除	盐、蛋白质、非公司染料/荧光和核苷酸和苯酚	胡敏酸、单宁、多酚黑色素	盐、蛋白质和基于大小的碎片

的RNA清理工具,包括RNA清洁&集中器(RCC)包和益生元清洁&集中器(OCC)包是兼容dsDNA ssRNA dsRNA, ssDNA(包括互补)。清洁和集中器表2中包洗提总RNA进行了优化和其他单链片段不洁净或稀释的抽取。

而RNA恢复工具包提供精确的尺寸选择双链和单链核酸。这些工具删除不需要的盐,蛋白质,和碎片琼脂糖或页面孤立的样本。

PCR抑制剂删除工具:

OneStep PCR抑制剂删除工具产生高质量的DNA或RNA和突出的能力只有结合PCR抑制剂和核酸。这些工具由一个快,一步程序清洗不纯的样品PCR之前,测序和逆转录(RT), 50 - 90%的回收率。列矩阵有效去除污染物,可以抑制下游应用,如胡敏酸、单宁、多酚、黑色素。在环境样品像粪便一样,这些抑制剂常见土壤、植物和种子。

选择相似的包

DNA清洁&集中器与基因组DNA清洁和集中器设备

DNA清洁&集中器(DCC)包和基因组DNA清洁&集中器(gDCC)包都是优化dsDNA样品,但是他们也可以绑定单链、cDNA片段与协议的修改。

如果DNA片段< 10 kb,那么DCC是最优的。DCC复苏提供了更好的DNA小片段,50个基点——10 kb、70 - 90%的收益率

如果DNA片段> 10 kb,那么gDCC是最好的工具来实现最大的样本复苏。gDCC提供最佳的复苏更大的DNA片段,> 10 kb,在70 - 95%。

虽然包都是可伸缩的增加样品加工/预科,DCC工具包还与一个可选的自动化功能磁珠的格式。

浅颜色-总大小的范围内
深点的颜色-最佳大小的范围内

Zymoclean DNA凝胶回收与Select-a-Size DNA清洁&集中器设备

恢复时精确的大小选择dsDNA碎片从琼脂糖凝胶Zymoclean DNA试剂盒是最好的。的Zymoclean DNA凝胶回收设备最佳复苏所需的dsDNA孤立的片段从50 bp - 10 kb 70 - 90%,与典型的复苏而Zymoclean大片段DNA恢复工具包最好的恢复孤立样本10 kb > 200 kb。

另一方面,Select-a-Size DNA清洁和集中器套件可以对大小进行优化,使其选择在一个广泛的dsDNA片段不需要凝胶切除术。操纵滴定被切断允许定制的选择性分离的片段范围的兴趣。这个工具包可以操纵一个尺寸选择距离截止≥50 bp dsDNA和自动化准备好了磁珠可用的格式。