ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准

D6305 / D6306


ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准

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D6305 ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准 200 ng
D6306 ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准 2000 ng

文档



突出了

  • 准确的成分:作文旨在与多种类型的测量。
  • 微不足道的杂质:保证外国微生物DNA包含< 0.01%。
  • 广泛的GC活动内容:评估偏见的15% - -85%,由GC含量变化引起的。
描述

的新兴领域的主要挑战之一microbiomics偏差和错误中引入复杂的工作流。除了核酸纯化,偏见也源自测序图书馆准备和后续流程。ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准用来评估偏差,错误和其他工件后核酸纯化的步骤。这个标准是由DNA池DNA提取纯文化。它有一个准确的定义组成,微不足道的杂质(0.01%),包含了广泛的基因组的GC含量(15% - 85%)。这个DNA标准设计有相同的微生物组成与移动版本,ZymoBIOMICS微生物群落的标准,这样他们可以在串联工作时更强大。理论基于基因组DNA组成:单核细胞增多性李斯特氏菌- 12%,铜绿假单胞菌- 12%,枯草芽孢杆菌- 12%,大肠杆菌- 12%,沙门氏菌血清- 12%,乳酸菌酵母- 12%,粪肠球菌- 12%,金黄色葡萄球菌- 12%,酿酒酵母- 2%,新型隐球菌- 2%。

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纯度 < 0.01%外国微生物DNA
样本来源 十个微生物菌株的基因组DNA的混合物。
样品存储 -20°C
补充信息

我们建议从分析工作。第一次优化图书馆准备与ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准(D6305,D6311PCR)评估偏差,测序、生物信息学,等等。一旦你的结果相比低/无偏见的理论成分,然后使用整个细胞ZymoBIOMICS微生物群落标准(D6300,D6310)裂解效率评估的偏见。

不,微生物群落的标准是用来评估的效率裂解方法,目的是与你们的样品并行运行。如果所有附近的生物可以在/检测理论丰富,你可以自信的提取方法是公正的。

的化学试剂盒包(QIAamp Powerfecal, DNeasy Powersoil)和微生物群落标准存储的存储解决方案(DNA / RNA盾)不完全兼容的。相反,应该使用更少的输入量(25 ul)。

你可以找到参考基因组和16 s / 18 s序列:ZymoBIOMICS.STD.refseq.v2.zip

这可能表明一个问题与裂解方法,可以偏向革兰氏阴性细菌。看到优化裂解协议文件的桌子底下Zymo珠打设备和协议验证的研究。

设备发现上会tough-to-lyse生物在所有测试条件:

  • Retsch混合器米尔斯
  • 组织Lyzers
  • 议员快准备96年

我们使用一个内部策划数据库生成的数据标准。

请与技术支持联系tech@zymoresearch.com原始测序数据。

预期的DNA片段大小< 15 kb。

这可能表明偏差的工作流程,如裂解效率低下、图书馆或生物信息学分析做好准备。



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