ZymoBIOMICS微生物群落的标准

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ZymoBIOMICS微生物群落的标准

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ZymoBIOMICS®微生物群落的标准

突出了
  • 准确的成分:作文旨在与多种类型的测量。
  • 在DNA隔离评估偏差:含有微生物不同大小和细胞壁的固执(8 2细菌和酵母)。
  • Microbiomics质量控制:适合微生物分析质量控制。
描述

微生物成分分析技术的新一代测序成为常规microbiomics和宏基因组研究。然而,这些分析技术可以从收集到分析遭受重大偏差。ZymoBIOMICS微生物群落标准旨在评估偏见和错误microbiomics工作流的提取方法。微生物群落的标准模拟混合微生物群落的定义良好的成分,包含三个easy-to-lyse革兰氏阴性细菌,五tough-to-lyse革兰氏阳性细菌,和两个tough-to-lyse酵母。作为定义输入从一开始,微生物群落的标准可以指导施工和优化整个工作流,也可以用作日常质量控制。理论基于基因组DNA组成:单核细胞增多性李斯特氏菌- 12%,铜绿假单胞菌- 12%,枯草芽孢杆菌- 12%,大肠杆菌- 12%,沙门氏菌血清- 12%,乳酸菌酵母- 12%,粪肠球菌- 12%,金黄色葡萄球菌- 12%,酿酒酵母- 2%,新型隐球菌- 2%。

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纯度 < 0.01%外国微生物DNA
样本来源 十的混合物灭活微生物(细菌和真菌)。
样品存储 -80°C
补充信息

我们建议从分析工作。第一次优化图书馆准备与ZymoBIOMICS微生物群落DNA标准(D6305,D6311PCR)评估偏差,测序、生物信息学,等等。一旦你的结果相比低/无偏见的理论成分,然后使用整个细胞ZymoBIOMICS微生物群落标准(D6300,D6310)裂解效率评估的偏见。

不,微生物群落的标准是用来评估的效率裂解方法,目的是与你们的样品并行运行。如果所有附近的生物可以在/检测理论丰富,你可以自信的提取方法是公正的。

的化学试剂盒包(QIAamp Powerfecal, DNeasy Powersoil)和微生物群落标准存储的存储解决方案(DNA / RNA盾)不完全兼容的。相反,应该使用更少的输入量(25 ul)。

你可以找到参考基因组和16 s / 18 s序列:ZymoBIOMICS.STD.refseq.v2.zip。

这可能表明一个问题与裂解方法,可以偏向革兰氏阴性细菌。看到优化裂解协议文件的桌子底下Zymo珠打设备和协议验证的研究。

设备发现上会tough-to-lyse生物在所有测试条件:

  • Retsch混合器米尔斯
  • 组织Lyzers
  • 议员快准备96年

我们使用一个内部策划数据库生成的数据标准。

请与技术支持联系tech@zymoresearch.com原始测序数据。

预期的DNA片段大小< 15 kb。

这可能表明偏差的工作流程,如裂解效率低下、图书馆或生物信息学分析做好准备。

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